Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1AO95602 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1AO95602 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms