Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM2O94769 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECM2O94769 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECM2O94769 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM2O94769 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM2O94769 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM2O94769 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM2O94769 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM2O94769 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms