Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNKO75909 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms