Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCATO75600 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCATO75600 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCATO75600 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GCATO75600 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCATO75600 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms