Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms