Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD4O60885 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD4O60885 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD4O60885 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD4O60885 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD4O60885 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD4O60885 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD4O60885 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms