Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6DO43924 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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PDE6DO43924 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PDE6DO43924 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6DO43924 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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