Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms