Protein–RNA interactions for Protein: O43301

HSPA12A, Heat shock 70 kDa protein 12A, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA12AO43301 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPA12AO43301 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms