Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARPC1BO15143 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARPC1BO15143 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms