Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EBAG9O00559 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EBAG9O00559 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms