Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PATL2C9JE40 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PATL2C9JE40 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms