Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIPT2A6NK58 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms