Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L3A6NE82 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms