Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRGMA1A4Y4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms