Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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