Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC61Q9Y6R9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC61Q9Y6R9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms