Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX6Q9UNH7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms