Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRXN1Q9ULB1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms