Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DCTN4Q9UJW0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms