Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms