Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms