Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFIP11Q9UBB9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms