Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EHD3Q9NZN3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EHD3Q9NZN3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms