Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM53CQ9NYF3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM53CQ9NYF3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FAM53CQ9NYF3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FAM53CQ9NYF3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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FAM53CQ9NYF3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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FAM53CQ9NYF3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FAM53CQ9NYF3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM53CQ9NYF3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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