Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MED17Q9NVC6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms