Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM106BQ9NUM4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms