Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMC4Q9NTJ3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms