Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTPS2Q9NRF8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms