Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SEMA4BQ9NPR2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms