Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms