Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SHARPINQ9H0F6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHARPINQ9H0F6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms