Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PUS3Q9BZE2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PUS3Q9BZE2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms