Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCGF6Q9BYE7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms