Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms