Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HDHD3Q9BSH5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms