Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms