Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PHF12Q96QT6 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms