Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms