Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF185Q96GF1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms