Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLIP3Q96DZ5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms