Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF428Q96B54 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms