Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHE22Q8NFJ8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHE22Q8NFJ8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms