Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK2A3Q8NEV1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms