Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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ZNF548Q8NEK5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF548Q8NEK5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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