Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE23Q8NDY6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms