Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms