Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGSF1Q8N6C5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGSF1Q8N6C5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms