Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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