Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VPS8Q8N3P4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VPS8Q8N3P4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms